早速、FFFTP 1.98c をインストールしてみました。私が契約している「さくらインターネット」は、FTPS(FTP over SSL) には対応しているのですが、FTPS Implicit に対応しているかまではわかりません。多分対応していないと思われます。FTPS – Wikipedia によれば、「FTPSには、認証コマンド（AUTHコマンド）実行後に暗号化通信を開始するExplicitモードと、FTPSサーバ接続開始時点から暗号化通信を開始するImplicitモードの2種類が存在する。」と書かれています。
「さくらインターネット」の場合は、「暗号化なしで接続許可」のチェックを外しておいた方がいいでしょう。
「FFFTP 1.98c」公開、FTPS Implicitに対応 -INTERNET Watch
Windows向けFTPクライアント「FFFTP」の最新版となる「バージョン1.98c」が5日、公開された。
FFFTP 1.98cでは、FTPS Implicitによる接続に対応し、アスキーモード転送の際の漢字コード変換でUTF-8（BOMなし）への変換をサポートした。また、日本語ドメイン名のホストへの接続時にアドレスをPunycodeに変換してから接続するようになったほか、ホストへの再接続時にホストの現在のディレクトリが再設定されないバグなど、複数のバグを修正している。
FFFTPは、オープンソースのフリーソフトウェアとして広く使われているWindows向けFTPクライアントソフト。2011年8月に作者のSota氏が開発の終了を宣言したが、有志により開発・バージョンアップが行われている。
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